使用各种消毒剂是消灭病源的有效方法。用得及时，能起到防疫灭病、切断疫源的作用。
1. 过氧乙酸
本品为40%的无色透明液体，是一种强氧化剂，能够杀死所以微生物和芽孢。用0.5%浓度可用于畜舍、车轮消毒，消毒后没有遗留残毒和药物，对真菌、细菌和病毒都有杀灭作用。
2. 烧碱
又叫氢氧化钠，对病毒、细菌有强大灭杀力，如口蹄疫、羊痘、羊链球菌等，用时配成1%-2%的水溶液，可用于羊舍内外消毒。但对金属用品有腐蚀作用，应禁用。对饲养用具、羊舍地面、槽具消毒，2小时后得用清水冲洗净残留药液。防止对人畜皮肤和黏膜的伤害。
3. 石灰
新鲜石灰（生石灰1份加水1份溶解）配成10%-20%的水溶液，可用于消毒洗刷圈舍、地面墙壁和粪便、排污沟等。还可以降低硫化氢（臭气）的浓度。
4. 来苏尔
以5%的水溶液消毒圈舍、地面和排泄物，对细菌和病毒尤其是对结核病，有良好的杀灭作用。
5. 百毒杀
配成3%的水溶液可用于内外环境消毒和用具消毒杀菌，也可用于羊体喷雾消毒。
6.新洁儿灭
本品为良好的杀菌消毒药，0.1%的水溶液可用于玻璃、搪瓷、衣物、材料、橡胶制品和皮肤消毒，但本品不能和碱性物质如肥皂、洗衣粉等接触，否则会降低消毒作用。
7. 草木灰
常用新鲜草木灰10千克加水50千克，20分钟后，取上精液，喷洒圈舍、地面、用具，能杀灭细菌和病毒。
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