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一、转变创新理念
兽用新药研发是一个系统工程，企业应根据实际确立正确的创新理念。
首先，开发一个兽用创新药物需要高投入，且具有极大的不确定性。开发兽用创新药物的投入主要用于临床试验和上市。虽然在我国开发新药成本相对较低，但资金需求量大的特点没变。企业应该做好必要的准备。
第二，不要强求获得完全创新的新兽药。新兽药的创新性具体体现在化合物结构、适应症、中间体、制造纯化工艺、剂型和包装材料等方面。开发创新药物的技术要求极高且极全面，包括精细化工、合成、纯化、制剂、药理毒理技术、临床组织和市场策划等。企业应依据自身实力，积极与国内有实力的单位密切合作，选择适合企业发展的创新项目进行开发，这样往往能取得较好的效益。
第三，按照《兽药注册办法》和农业部442号公告“兽药分类和注册资料要求”进行系统研究并组织材料。
第四，不要急于求成，一定要按新兽药的研发规律去安排工作，不能要求从活性物质一步跨越到候选药物，应按规律进行扎实的前期研究。在新药开发阶段，由于化合物的药物代谢和毒性原因导致开发失败的占40％一60％，因此应尽可能在前期研究中，以较合适的成本获得待开发化合物的安全性、有效性和药物代谢性质的资料，以判定这个化合物或活性物质有无开发价值，并按价值大小分类管理。在临床前药效学实验方面应注意如下规律：新药药效要有特点且高于或不低于已有药物；应用公认的药效标准判定效果的好坏；已有药物疗效比较显著的话，则新药疗效的标准会比较高。从毒性试验角度看，应选择安全剂量范围大、作用选择性强的化合物进行开发。
二、体制创新
最大限度的利用、组织现有的人、财、平台资源，围绕创建若干从靶点研究到产品上市完整的新药研发平台建设，这个组合的平台应具备企业的性质，应具备合理的法人治理机构和完善的现代企业制度。
三、注意市场前景
新药是指未在我国上市销售的药品。事实上并不是所有的新药都值得投资。新药是否具有开发价值，要看其是否有较高的市场需求和较强的竞争力，疗效及辅助作用、毒性、用药的依从性、生产成本、工艺和动物产品安全等方面是否有优势，而有经验的临床兽医和集约化养殖集团公司的研究人员在这些方面很有发言权。因此，在引进或开发新品种时，最好听听相关专业兽医的意见，以了解现有品种的优缺点和市场有无新需求，而不只是从技术角度来判定产品的开发价值。
四、关注而不拘泥于国外研究进程
随着对外交流的增多，国内企业越来越注重国外，有的归国学者也带回技术或品种转让给国内企业，但千万别偏听和迷信国外，而避免影响自己的研发进程。关注国外的研究进程有助于调整和完善自己的研究思路和方法。应充分利用自身得资源优势，借助或联合国内高水平的药物研究机构、动物疫病研究所、动物福利研究机构，重视兽用药物筛选和前期研究。
五、注意研发途径
（一）加大制剂研究的力度
药物的制剂研究和生产工艺改进提高在国外制药企业中重视程度相对不够，他们的主要注意力放在开发新药上。我国兽用制药-I-_业(包括人药)虽然新药开发能力差，但长于跟踪仿制，对改进生产工艺，降低生产成本投入较多。
（二）从资源丰富的天然药用植物中寻找新药
我国有着丰富的天然药用植物，利用现代植物化学、生物化学方法从天然药物植物中寻找新的药用化合物可能是一条捷径。国际、国内的医学领域都有这方面成功的先例，如抗癌药物紫杉醇是从太平洋冷杉的树皮中提取的，红豆杉树皮中含量也很丰富。抗疟疾药物青蒿素是从传统中药黄花蒿中提取得到的。我国传统使用的疗效显著的中药材、中成药品种众多，可以探索从中分离出一种或数种单一分子的有效成份，利用现代药理学方法阐明其机理，可能会有所收获。医学上的葛根粉针、双黄连粉针、穿琥宁粉针等已经开发成功并进入市场。
（三）充分利用生物技术，高起点利用生物技术开发新药
我国利用生物技术开发兽用新药取得了长足进步，且研究成果丰硕。如猪白细胞干扰素、精制蛋黄抗体、基因工程疫苗、转移因子、微生态制剂、益生素制剂等都已经进入市场并获得较高认可。
六、构建强—强联合的企业集团
不同企业和不同的科研院所应当以项目的形式进行强强联合，实现人才、资金、技术、设备、市场的优势互补，提高兽用药品的技术开发和技术创新实力，抵御兽药技术和兽药产品的低水平竞争。目前，国内动物药品领域已经出现了良好的强强联合态势，如中牧集团、信得华西集团、精华集团等，都在着力打造GMP后时代的动物药品竞争重舰，但这种优势还没有得到特别体现。不过，其它行业的案例已经彰显出强强联合的技术研发优势。