科学技术的不断发展与进步，使人们探索自然规律和揭示生物多样性成为可能。20世纪猪育种的最大进步是使猪的日增重突破800克/日，瘦肉率达到60%以上，料肉比达到2.8∶1，出栏猪156天体重达到90千克以上，培育出了真正的瘦肉猪。近几年，随着育种理论与实践的不断发展，养猪业发达国家的猪育种已从品种选育逐渐过渡到专门化配套选育，针对各个品系在杂交体系中的不同用途，突出重点性状进行遗传改良，然后系间配套杂交，综合各品系的优势会提高商品猪的生产性能和经济效益。培育配套系，首先要有一个完整的杂交繁育体系，在此基础上通过对核心群亲本的选育以培育亲本系，然后通过杂交配合力测定确定杂交组合，并生产父母代或繁殖群以提供商品仔猪。根据分析，在养猪生产中建立起这一套完整的体系，虽然需要一定的投入，但是在经济上是最有利的（陈润生等， 1997年）。此外，如果没有完整的杂交繁育体系，育种工作将没有依托，引入品种的生产性能也难以得到保持和提高，这就是我们建立新杂交繁育体系的目的所在。
1 猪的育种目标
1.1 决定猪育种目标的因素主要是市场和消费需求，而动物的育种目标是指育种者选育优良的种用个体，确保生产群体在预期的生产和市场条件下获得最大的经济效益（Meuwissen,1998）。同时育种目标受地域、文化、习俗及市场需求等因素影响。不同目标、不同地区以及不同时期的育种目标也各不相同。育种目标的发展经历了从注重畜禽生物学特性到追求最大经济效益等漫长的发展过程。20世纪以来，猪的主要目标性状是生长速度，饲料效率和胴体瘦肉率。虽然上述的目标已经达到或超过，但是也带来了一些问题。一是肌肉脂肪含量（IFM）下降，如丹麦1978－1992年长白猪、约克夏猪、杜洛克猪的IFM下降了50%，长白猪和约克夏猪仅为1%左右，杜洛克也由4.15%下降到2.05%。二是猪的应激综合症发生的比例提高，猪肉的品质下降，PSE肉 和DFD肉的发生率提高。
1.2 21世纪猪的育种目标必须根据市场和消费者的需求不断调整。从生产者的角度来说，需要以最低的成本和大众可接受的方式生产优质瘦猪肉。育种目标有三个不同方向：一是提高已有较高水平的生产性能（包括瘦肉率、瘦肉组织生长速度、饲料效率、胴体品质和体形、每头母猪年产仔数及均匀度）的潜力，二是最大可能的在实际生产中，充分表现这些潜力（包括猪群的抗病力、适应性和抗应激能力）选择限没有追近的信号，因此有理由推测，在下个10年BLUP选择，梅山猪品种和雌激素受体基因二者效应的可能结合产生的遗传改进量可使窝产仔数每窝多4个活仔，30～100千克生长阶段平均日增重高达1千克。第三个育种方向就是品质育种。因为在国际市场供过于求、买主挑剔、竞争激烈的形势下，不断创新优质猪、优质肉、特色肉是最有前途的，如台湾已开始建立台湾优良黑色猪生产体系。
1.3 对以猪肉为重要食品的国人来说，必然会对猪肉质量提出越来越高的要求，因此，21世纪所培育的猪应具有以下特色：
1.3.1 要具有中国猪的高繁殖及哺育能力；
1.3.2 生产性能和饲料转化能力高；
1.3.3 商品猪瘦肉率高，肉质好，肌间脂肪多，背膘薄而均匀，腹脂少；
1.3.4 有良好的体质，抗病及抗应激能力强，免疫机能健全，良好的生活力。
2 育种新技术的应用
进入90年代以来，随着生物技术和信息技术的迅速发展，国际上的动物育种已逐渐进入分子水平，运用联合育种的方式使优良个体性状得以扩大，大大加快了育种的进展，使猪的生产性能得到了很大的提高，根据美英等发达国家和FAO的预测，21世纪全球商品化生产的畜禽品种将通过分子育种技术的培育，品种对动物的贡献率将超过50%。
2.1 分子生物技术
分子生物技术在猪育种当中的应用主要有以下方面：
（1）猪的基因标志技术（Gene mepping），其主要目标是寻找重要经济性状（如瘦肉率、产奶量、抗病性等）位点势与已连锁的DNA标记，并将其用于分子标记辅助选择来改良畜禽品种。提高选择的有效性及遗传改进量。目前在猪19对染色体上，已有近3000个标记。
（2）猪数量性状、主效基因的检测与利用、定位数量性状位点（QTL）等。常用的方法是分离分析法、候选基因法和基因组扫描法。目前，猪应激综合症基因、窝产仔数候选基因等已在育种中应用。
（3）数量性状的标记辅助选择。在猪育种中，对遗传力较低（如繁殖性状）、度量费用昂贵（如抗病性）、表型值在发育前早期难以测定（如瘦肉率）或限性表现（如产奶量）的性状，如用标记辅助选择（MAS），则可提高选择的准确性和遗传进展，提高育种效率。
2.2 联合育种
联合育种的目的是解决小群体选育所面临的问题。将计算机、网络、分子生物技术以及遗传育种理论的最新方法等现代科学技术应用到猪育种当中去，增加核心群体的数量，提高选择强度，减缓近交衰退，加快遗传进展，提高猪的遗传水平。主要测定的性状是：达到100千克体重的日龄、产仔数、背膘厚及眼肌面积和肉质性状。育种结构的形式为金字塔形，即由核心群、繁殖群及商品群组成。在核心群主要进行纯种性能的选择提高；繁殖群的主要目的是扩大良种的数量和生产杂种父母代；商品群主要进行杂种或纯种猪的商品猪生产（Shephe 1997）。组织结构由内决策层、中间管理层和底层管理组成。总之联合育种可以提高遗传进展和育种值估计的可靠性，降低近交增量。
2.3 计算机信息技术
一是遗传评估系统的建立。选种是育种工作的关键环节，正确的选种要基于对畜禽遗传质的准确评定。50年代初，美国学者Charlesr.Herelerson提出了最佳线性无偏预测（BLUP）法，可以大大提高遗传改良的进度，如加拿大自从1985年开始应用动物模型 BLUP法以来，背膘厚的改良速度提高了50%，100千克体重日龄的改良速度提高了100%～200%。
二是计算机图像分析系统的应用。在猪的育种实践中通过图像可分析B超活体测定的背膘厚以及眼肌面积，不必等屠宰后进行测定，这样不仅降低了测定费用，而且加大了选择强度，提高了选种的准确性。
三是通过信息网络技术的应用，实现了信息共享，使所有育种者或公司都能收益。
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