由于豆渣的营养特性，所以说是喂猪、喂鸡、喂鸭等的好饲料，目前豆渣大都简单地直接用于饲喂牲畜，没有经过处理，又或是简单的蒸煮加热处理下，有句俗语“豆渣喂猪，越喂越缩”，这主要是因为豆渣中含有抗胰蛋白酶、皂素、血凝素等抗营养因子，其中胰蛋白酶抑制因子，它能阻碍猪体内胰蛋白酶对豆类蛋白质的消化吸收，造成腹泻，影响生长，适口性差，难于消化，饲料效价低。
经过微生物发酵处理，豆渣中蛋白质能够得到有效降解,从而使豆渣中氨基酸态氮的含量得以大量提高，豆渣在除异味、改良口感、细化颗粒、纯化营养、阻碍因子等方面进行了改善，这是一种有效利用豆渣的方法。
发酵豆渣的好处：
1.彻底消除豆渣的三大抗营养因子，提升豆渣品质；如最主要的三种抗营养因子：即胰
蛋白酶抑制素、致甲状腺肿素、凝血素，其中胰蛋白酶抑制因子，它能阻碍猪体内胰蛋白酶对豆类蛋白质的消化吸收，造成腹泻，影响生长。
2.可以适当平衡豆渣的能量蛋白比例，因为发酵降解了蛋白，提高了蛋白消化吸收率
并产生了小肽等免疫增强物质，蛋白自身的消化率的提高，相应减少了对能量的需求，同时，发酵分解了豆渣中的非淀粉多糖和纤维素等，产生单糖和低糖，相应增加了可消化能量值；
3.收集的豆渣往往容易变质，由于含水量在，极易滋生杂菌甚至有害菌，变质变味，
发酵后的豆渣，只要密封好，几乎可以永久保存，不会变质。
4.圈舍臭味明显减少：确实感觉得到，效果直接；这一是因为发酵豆渣酸化肠道的作用，降低了粪便PH值，抑制了氨气的产生，二是因为随着粪便一起排泄出来的，还有大量的乳酸细菌，它们在排泄后，仍然在发挥着发酵粪便的作用，有力地缓解了臭气的产生。
5.养殖场使用发酵的豆渣，可完全不用抗生素，生产无抗生素的猪肉，肉质风味好，绿色环保。其综合原理就是发酵豆渣中的乳酸菌、酵母菌、乳酸等有机酸酸化剂、乳酸链球菌素、小肽、以及各种抗应激小分子营养物质包括特殊维生素营养物质综合作用的结果。
6.降低饲料成本，提高经济效益。使用发酵豆渣，由于得病率大为降低，不仅减少医药开支，而且可提高配合使用的饲料的消化吸收率，降低料肉比，提高饲料报酬，加上豆渣本身的价格相对低廉，所以，也有助于养殖户降低养殖成本。
发酵豆渣的方法：
豆渣属于蛋白原料，发酵过程中需要添加能量物质，以得到蛋白能量平衡。能量物质为玉米粉、薯干粉、米粉、大小麦粉、稻谷粉、次粉、高粱粉等，以及含能量较高的如以米饭面食为主的潲水，淀粉渣，薯渣等能量类糟渣。
1.首先准备好要发酵的物料：豆渣、玉米粉、益加益饲料发酵剂或者是水剂菌液，如果豆渣过湿，还可备些米糠、麦麸类吸附豆渣多余水分。
2.然后先把饲料发酵剂活化成液体菌液，或者直接购买益加益饲料发酵菌液。然后和玉米粉拌在一起，拌到能撒开的干湿度。
3.然后把拌好的玉米粉和豆渣混合一起，搅拌均匀，控制干湿度在60%左右，即手握一把成坨，用力握不出水的感觉即可。
豆渣一般含水量较大，用户可添加部分米糠或者麦麸吸附水分，如果豆渣过干则可多喷洒清水，灵活操作。
4.然后把拌好的豆渣装在缸里、桶里等密闭容器里，发酵5到7天闻到酸香味道即可取用。
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