1.清洗消毒 加强卫生是防止仔猪下痢的主要的措施之一。产栏地面上存留着母猪乳汁及仔猪下痢所形成的脂肪层、残存的粪便和饲料等，其中含有大量的病原微生物，这是导致仔猪下痢的主要传染源。因此，只有彻底清除脂肪层及残存的粪便、饲料等，才能有效的控制仔猪下痢。
冷水、高压热水不能将脂肪层溶解而清除。消毒剂也不能去除这层脂肪层，因为消毒剂不能溶解脂肪，而只能吸附在脂肪层的表面。此外，让消毒剂残留在产栏地面上干燥也是不可取的，因为干燥的消毒剂接触到潮湿的仔猪皮肤后会形成溶液而灼伤仔猪。
因此，清洗产栏前应先用洗涤剂或烧碱溶液浸泡地面，然后再用高压水冲洗地面，以彻底清除地面上的脂肪层及产栏内的残留饲料和粪便。进行彻底清洗后，再用消毒剂喷洒圈栏和地面，干燥后可再次冲洗产栏，这样即可有效地避免消毒剂对仔猪的损伤。经清洗消毒后的产栏再空栏干燥2～3天，就可将临产母猪转入产栏待产。临产母猪转入栏前，也应进行彻底的清洗，特别是乳房和阴部。
2.全进全出 实行全进全出的产仔制度，有助于控制新生仔猪下痢。因为只有采用全进全出，才可能对产栏进行彻底的清洁和消毒。
3.环境控制 仔猪生活在舒适的环境中，可以增强仔猪对传染病的非特异性抵抗力。对仔猪来说，舒适的环境并不仅仅是清洁、干燥，还应该温暖而无贼风。环境条件的改变会使仔猪应激而发生下痢等疫病。饥饿和脱水也会使仔猪发病，因此，吃饱母乳和饮用充足的清洁饮水对控制仔猪下痢也十分重要。
4.免疫措施 对妊娠后期的母猪免疫接种大肠杆菌疫苗，以及在妊娠后期用下痢仔猪的粪便饲喂妊娠母猪，均可有效地刺激母猪产生免疫力。这种免疫力可以通过乳汁传递给仔猪，从而提高仔猪对下痢等疫病的抵抗力。
5.及时治疗 如果因预防措施无效而使仔猪下痢，应立即对仔猪进行治疗。如果等到发病后的第二天才开始治疗，就会延误治疗时机。
总之，在控制新生仔猪下痢时，应加强卫生，提高仔猪免疫力，调控仔猪的生存环境，以增强仔猪的非特异性抵抗力。
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