必须在猪群健康的情况下才可以免疫注射，不能够确定是否健康的猪，为了防止呼吸系统综合症对免疫系统和免疫效果的影响，最好能够饲料加药净化后再予以免疫注射。净化药物的选择应该是对免疫系统无害的药物。那些严重影响免疫系统甚至导致免疫抑制的药物，例如氟苯尼考、地塞米松等必须慎重选用。许多的猪场做苗后诱发了大规模的群发病，导致群死群伤，就是因为猪群在隐性感染病原微生物的情况下，做苗应激诱发的。
关于疫苗的同时注射，副反应小的如气喘病、萎鼻、伪狂犬可同时分点注射。B，死苗也可以同时分点注射。C，副反应大的禁止同用，间隔最少一周。举例如下：猪瘟和口蹄疫同时使用相互没有影响。口蹄疫和蓝耳病灭活苗同时使用有协同作用。但是，三者绝对不可以同时使用。一般先打猪瘟，7天后，口蹄疫和蓝耳病灭活苗分点注射。
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